Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01669 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01669 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01669 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01669 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms