Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01648 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01648 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01648 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01648 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01648 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms