Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnb1P01575 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnb1P01575 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms