Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BlmO88700 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BlmO88700 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BlmO88700 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BlmO88700 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BlmO88700 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BlmO88700 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BlmO88700 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms