Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnmt3bO88509 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms