Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xirp1O70373 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xirp1O70373 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms