Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms