Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad51dO55230 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rad51dO55230 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms