Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx4O55187 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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