Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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BckdkO55028 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BckdkO55028 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BckdkO55028 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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BckdkO55028 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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BckdkO55028 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BckdkO55028 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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