Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc3O55013 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms