Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip3O55003 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnip3O55003 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms