Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffbO54788 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffbO54788 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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