Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk2O54781 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk2O54781 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms