Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CrxO54751 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms