Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sp100O35892 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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