Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms