Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lhx8O35652 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms