Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms