Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RaxO35602 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RaxO35602 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RaxO35602 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaxO35602 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaxO35602 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms