Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptch2O35595 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptch2O35595 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ptch2O35595 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptch2O35595 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms