Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms