Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn9O35239 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn9O35239 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms