Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms