Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd9O35177 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Nedd9O35177 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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