Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms