Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Polr1aO35134 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1aO35134 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms