Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif1cO35071 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif1cO35071 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif1cO35071 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif1cO35071 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms