Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn4O35054 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn4O35054 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn4O35054 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms