Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neurod4O09105 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms