Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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