Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema3aO08665 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms