Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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