Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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