Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20795J3QP49 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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