Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21976J3QNN2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21976J3QNN2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms