Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20873J3QMQ9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20873J3QMQ9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms