Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn34c3J3QJW5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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