Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21818J3KMS6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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