Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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