Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms