Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2610008E11RikG3X964 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610008E11RikG3X964 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms