Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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