Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9yF8VPU6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9yF8VPU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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