Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8005F6YKY3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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