Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm10378F6XQQ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Gm10378F6XQQ1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm10378F6XQQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm10378F6XQQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm10378F6XQQ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gm10378F6XQQ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm10378F6XQQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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