Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm8247F6VRJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8247F6VRJ8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms