Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms