Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms