Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4E9QAP7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4E9QAP7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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